在阴离子聚丙烯酰胺絮凝剂中，一般是水解后呈阴性的基团，如--COOH多，水解程度强。很多SS类型物质的表面往往带有电荷，显然，同样带有电荷的絮凝剂就可以利用异性相吸的原理来絮凝SS类型的物质。电荷中和后再利用阴离子聚丙烯酰胺本身的分子长连结构把污水中的细小颗粒絮凝成大团物质而形成大的絮团。而形成的较大的絮凝团就会随着重力的增加沉到水体底部，水体上部就较为清澈，这个是污水阴离子聚丙烯酰胺絮凝剂的基本絮凝原理。